一、PRM 研究背景
1.1 PRM 技术介绍
如今,蛋白组学的研究大多都是利用基于质谱的 bottom-up 的方法进行研究,
其中最为常见的是基于高效液相色谱的鸟枪法。LC-MS/MS 具有强大的蛋白定性
能力,但是在定量上其灵敏度仍有待提高。近年来,基于质谱的多重靶向蛋白质
组学技术,在蛋白精准定量上展现了更高的灵敏度以及良好的重现性。
选择反应监测(Selected Reaction Monitoring,SRM)是靶向蛋白组学的金标
准,平行反应监测(Parallel Reaction Monitoring,PRM)是其衍生技术。PRM 技术
在整个液相分离过程中会不断地对每一个目标母离子的全部碎片离子图谱进行记
录。相比于 SRM 只检测目标离子对的模式,PRM 检测所选择的母离子窗口内的
所有碎片信息。PRM 技术依赖于高分辨率的质谱仪,需要仪器的扫描速度足够
快,以便在高效液相色谱中能够获得足够多的数据点[1, 2]。
PRM 主要的优势就是使用了超高分辨率的 Orbitrap 质量分析器,其能够将
干扰信息与真实的信号进行区分,以及相比于传统的 SRM 方法能够更好的保证
分析的选择性。其缺点是能够监视的母离子的数量取决于 Orbitrap 分析器的工作
循环或瞬时长度以及色谱条件,不过其数量能够通过利用 time-scheduling、
parallelization 和降低 Orbitrap 的分辨率来增加。