二代宏基因组测序

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二代宏基因组测序

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品牌：oebiotech/欧易生物

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宏基因组学（Metagenomics），又称元基因组学，是由 Handelman 提出的一种直接对微生物群体中包含的全部基因组信息进行研究的手段，以特定生境中的整个微生物群落为研究对象，采用高通量测序技术，获得环境微生物基因组信息总和，以研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能以及代谢通路等。之后 Kevin 等对 Metagenomics 进行了定义，即“绕过对微生物个体进行分离培养，应用基因组学技术对自然环境中的微生物群落进行研究”的学科。它规避了对样品中的微生物进行分离培养，提供了对无法分离培养的微生物进行研究的途径，避免了实验过程中由环境改变引起的微生物序列变化所带来的偏差。宏基因组测序具有以下优点：微生物无需分离培养，且通过该技术可以客观还原微生物菌群结构：宏基因组测序技术，无PCR扩增环节，可以避免非特异性扩增问题，并且可以完整呈现微生物菌群的结构。在客观还原菌群结构的基础上，同时可以对群落微生物的功能进行研究：基于16S核糖体的微生物多样性研究方法，可以基于物种丰度进行功能丰度的预测，但是不能更进一步探究微生物的具体功能。而传统的微生物基因组方法，也需要构建大量的克隆筛选文库，才能获得微生物的功能基因。宏基因组测序可以直接基于环境中的所有微生物的基因序列，进行微生物的基因相关功能研究。

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