采用Illumina PE150测序平台,完成转录组信息采集,每个样品产生_6Gb数据量,并完成相应的信息分析。
(有参考基因组) |
具体分析内容 |
备注 |
基础分析 |
1.原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理; 2.测序数据产量统计及质量评估; 3.参考序列比对分析; 4.基因表达水平分析(PCA分析,限两组或以上样本); 5.转录本整体质量评估; 6.样本间相关性分析(两个或以上样本); 7. 基因差异表达分析(两个或以上样本); 8.差异表达基因表达模式聚类分析(两个或以上样本); 9.差异表达基因功能注释及GO、KEGG富集分析(两个或以样本); 10. 新基因、转录本预测; 11.新基因功能注释:GO、KEGG、NR、swissprot与COG功能注释分析; 12.SNP/Indel检测; |
需甲方向乙方提供所做样本的参考基因组序列及注释文件 |
高级分析 |
13.差异表达基因蛋白互作网络分析(两个或以上样本); 14.转录因子分析(仅限动、植物); 15. lncRNA鉴定; 16.差异可变剪切。 |
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备注 |
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好评度 | 商品满意度 | 服务满意度 | 发货满意度 |
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