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De novo |
具体分析内容 |
备注 |
原始数据 处理 |
1.原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理; 2.数据产出统计及数据的成分和质量评估, |
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基因组HiFi组装 |
3. 基因组组装: 3.1组装; 3.2 组装结果统计; 3.3 GC含量分析和GC-depth分布分析; 3.4基因组覆盖度统计; 4.基因组完整度评估 |
默认用过滤后的HiFi数据进行组装 |
Hi-C辅助组装 |
Hi-C辅助染色体构建 1.原始数据质控; 2.数据产出统计; 3.与参考基因组比对及数据过滤; 4.染色体构建; 5. 结果准确性评估及校正; 6. BUSCO评估。 |
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Hi-C:基于1和2中基因组特征的前提条件90%以上的序列总长度锚定到染色体上。 |
复杂基因组,不承诺挂载率 |
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具体分析内容 |
备注 |
基因组注释 |
1. 基因组注释: 1.1重复序列注释; 1.2编码基因预测; 1.3编码基因功能注释; 1.4 非编码RNA注释 2.基因功能注释 2.1 GO、KEGG、InterPro、NR、TrEMBL、Swiss-Prot和Pfam数据库注释 |
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转录组辅助注释 |
3.数据产出统计及数据的成分和质量评估,用于基因组的注释; |
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高级分析与个性化分析 |
4、功能注释高级分析 4.1碳水化合物活性酶(CAZy)数据库注释; 4.2 效应因子 4.3 致病性分析 4.4 CARD 抗生素抗性基因注释 |
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好评度 | 商品满意度 | 服务满意度 | 发货满意度 |
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