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DeepBio得分:5567.2
DeepBio得分
是基于文献引用次数，影响因子，文献新近度等因素计算的客观产品评级，得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证，质量可信度越高
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具体分析内容 |
备注 |
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数据质控 |
1.测序数据质量控制； 2.数据过滤比对； 3.文库插入片段长度分布； 4.TSS富集分析； 5.Genebody区富集分析； 6.Peak检测和peak富集分析； 7.Peak可重复性分析； 8.数据可视化。 |
甲方需向乙方提供此物种的参考基因组及注释信息的准确链接 |
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高级分析 |
1. Peak关联基因的注释 2. Peak的Motif分析 3. CUT&Tag信号在TSS的分布； 4. CUT&Tag信号在Gene body的分布； 5. 组内总Peak及组间Overlap Peak 6. 组间差异Peak（DP）检测； 7. DP信号值的聚类 8. DP的位置分布 9. DP关联基因的注释 10. DP的Motif分析 |
样本间差异分析建议每组至少2个生物学重复。甲方提供用于比较的分组情况。 |
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个性化分析 |
1.与RNA-seq数据联合分析： 1.1 CUT&Tag信号强度与基因表达水平的关系 1.2 差异Peak关联基因与差异表达基因overlap分析 1.3 多组学联合可视化展示 |
若甲方已有RNA-seq数据，甲方可向乙方提供对应样本的转录组数据结果文件 |
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（有参考基因组） |
具体分析内容 |
备注 |
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基础分析 |
1.原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理； 2.测序数据产量统计及质量评估； 3.参考序列比对分析； 4.基因表达水平分析（PCA分析，限两组或以上样本）； 5.转录本整体质量评估； 6.样本间相关性分析（两个或以上样本）； 7. 基因差异表达分析（两个或以上样本）； 8.差异表达基因表达模式聚类分析（两个或以上样本）； 9.差异表达基因功能注释及GO、KEGG富集分析（两个或以样本）； 10. 新基因、转录本预测； 11.新基因功能注释：GO、KEGG、NR、swissprot与COG功能注释分析； 12.SNP/Indel检测； |
需甲方向乙方提供所做样本的参考基因组序列及注释文件 |
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高级分析 |
13.差异表达基因蛋白互作网络分析（两个或以上样本）； 14.转录因子分析（仅限动、植物）； 15. lncRNA鉴定； 16.差异可变剪切。 |
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备注 |
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| 好评度 | 商品满意度 | 服务满意度 | 发货满意度 |
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