采用PacBio sequelⅡ测序平台,完成(2)个(小鼠)的全长转录组信息采集,每个样品不分库构建PacBio测序文库,每个样品产生_40_Gb数据量,并完成相应的信息分析。
采用BGI PE150测序平台,完成(6)个(小鼠)的转录组信息采集,每个样品产生_6_Gb数据量,并完成相应的信息分析。
(有参考基因组) |
具体分析内容 |
备注 |
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基础分析 |
全长转录组 (Iso-Seq) |
1.数据产出统计及数据的成分和质量评估; 2.结合二代数据进行纠错(甲方需向乙方提供对应样本的二代转录组数据); 3.参考序列比对分析(以基因组为参考序列,甲方需提供基因组链接、基因组结构注释文件和功能注释文件) 4.GMAP比对修正; 5.基因结构注释(基因loci、同源异构体isoform注释); 6.全长率评估; 7.新基因、新isoform注释; 8.新isoform功能注释(NR、GO、KEGG、KOG等); 9.新isoform ORF预测; 10.可变剪切(AS)分析; |
需要甲方提前向乙方提供相关的技术资料,详见分析条款后括号内内容 |
好评度 | 商品满意度 | 服务满意度 | 发货满意度 |
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