通过对细胞核内染色体构象进行固定、酶切、连接、捕获等步骤,对捕获的含有染色质互作信 息的片段进行高通量测序,再通过生物信息学分析,能够在全基因组范围内获得不同区域间染色 质DNA在空间位置上的相互作用,发现三维空间中的远程调控元件,揭示空间结构调控基因功能发 挥的机制。
Hi-C互作分析应用方向广泛但不局限于以下研究:(1)构建全基因组互作图谱,寻找线性距离 远而空间位置邻近的调控元件,研究基因组空间结构(compartment、TAD、loop结构)可揭示基因 组空间结构调控基因表达的机制;(2)研究病理细胞或组织的基因组三维结构,与WGS、RNA- seq、ATAC-seq、ChIP-seq等多组学联合分析,可深度解析疾病和癌症的发生机理;(3)比较细胞 生长发育或分化阶段的染色质空间结构变化,可揭示环境变化或生长发育过程中基因组三维结构的 适应性变化。
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