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本检测并非能覆盖到所有的基因突变,送检前请悉知以下局限性。
1、由于受基因组中存在与之高度同源序列的影响,包括但不限于SMN1、CYP21A2、IKBKG、GBA、HBA1、HBA2等等基因(由于数目众多,此处不逐一列举)尚不能单独依赖WES检测得到可靠的检测数据。因而本项目不报告此类基因的结果。若临床高度怀疑此类基因发生变异,请选择送检相应的、有针对性检测的项目。
2、本检测不报告线粒体环状DNA上的变异,若怀疑为线粒体环状DNA变异导致疾病者,可送检线粒体基因组全长检测项目(代码80405)。
3、由于碱基修饰造成的表观遗传改变,例如Prader Willi综合征相关的表观遗传改变。
4、内含子深部的变异, 缺乏有效的分析手段, 本检测无法覆盖(即使覆盖也难以解读)。
5、大部分基因表达调控序列,缺乏有效的分析手段,本检测并不覆盖(即使覆盖也难以解读)。
6、大多数的非编码RNA基因,缺乏有效的分析手段,本检测并不覆盖(即使覆盖也难以解读)。
7、面肩肱型肌营养不良相关的D4Z4片段重复数减少,以及类型为动态突变的变异,本检测无法覆盖。
8、包括但不限于染色体片段易位、倒位等仅造成基因组结构改变的变异,本项目无法检测。
9、对于拷贝数变异(CNV),本项目仅报告>100kb的片段。且本项目报告的所有CNV,均需加做其他方法学检测才能在临床上最终确认。
10、低比例的嵌合型变异(<25%),可能难以检出。
11、其他单独采用WES无法覆盖或检出的情况。
备注:仅限于省医课题组专用。
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