LC-MS/MS全谱代谢组检测代谢
原始数据首先使用MSconventer转换为mzML格式,再通过XCMS软件(版本:1.50.1)进行峰提取,至少在任意一组50%的样品中检测到变量(m/z,精确分子量)被提取出。最终得到包含一个精确分子量、保留时间、样本名称和峰强度(峰面积)的三维数据矩阵,使用自主开发程序去除同位素峰,并将内标峰从矩阵中删除。
总峰面积归一化:对每个样本所有的峰信号强度(峰面积)进行归一化处理,即用每个峰信号强度转化成在该谱图中的相对强度。从而使相对标准偏差(RSD)最小。
将QC样本中相对标准偏差(RSD)大于30%的变量删除。从表1.1可以看出,对QC样本以RSD<30%进行筛选,features得率>75%,说明该代谢组学方法具有的良好重现性。
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