MetproII基于质谱检测平台的蛋⽩质组学数据分析主要分为基础数据分析、常规数据分析两个部分。其中基础数据分析是对蛋⽩质组的定性定量结果进⾏数据预处理，筛选出显著差异的蛋⽩；常规数据分析是在基础数据分析的基础上，对显著差异的蛋⽩进⾏的⼀系列⽣物信息学分析。除此之外，我们还可以针对客⼾需求，定制⾼级数据分析，如多组学关联分析，发表⽂章的图表设计等。

.DIA技术（data-independent acquisition，数据非依赖采集）融合了传统蛋白质组shotgun的高通量和质谱定量金标准PRM的定量准确的优点，被Nature Methods杂志评为2015年最值得关注的技术。 技术原理 传统的蛋白质组技术shotgun、Label free、iTRAQ/TMT等在数据采集过程中存在较高的数据丢失和采集的随机性即DDA（data-dependent acquisition）的采集方式。在这个采集过程中，每个扫描周期内， 质谱只对丰度较高的信号进行二级信号采集，其余信号的二级信号则丢失了。 而DIA（data-independent acquisition）技术原理是将所有的信号预先划分为几块，然后对每块区域里面的所有一级信号，全部一次性进行二级采集。从而实现了高度的覆盖性，以及在此基础上的高度重现性。 DIA技术优势 1. 稳定性好：与传统的DDA采集模式相比，是无偏好的全息扫描，获得的信息全面，解析出的蛋白较普通LFQ方法多，稳定性更好，缺失值相对较少。 2.定量准确度高：定量准确度与PRM技术相当。 3.适用范围广：单个样本上机，能进行一定程度上的有或无鉴定，能用于不同组织类型蛋白表达谱的比较。 4.时间跨度大：样本中加入了保留时间校正的标准肽段，不受上样时间限制，能够对不同时间上机的样本进行保留时间校正后，进行整体数据分析，更适合大样本量，疾病类样本。