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货号:004
品牌:影子基因
计量单位:
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35天
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所属公司:武汉影子基因科技有限公司

所 在 地: 湖北省武汉市武汉软件新城3期D5栋4楼

服务电话(移):18672921912

DeepBio得分:5567.2
DeepBio得分 是基于文献引用次数,影响因子,文献新近度等因素计算的客观产品评级,得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证,质量可信度越高

  • 产品详情

标准信息分析:

1原始测序数据质控;

2质控后的测序读段与参考基因组比对及文库质量评估;

2.1测序读段与参考基因组比对

2.2评估及去除细胞质基因组污染

2.3测序读段在基因TSS附近的分布统计;

2.4.文库插入片段长度分布;

2.5.重复样品的相关性分析;

2.6.重复样品IDR分析;

3基因组范围内开放染色质区域鉴定;

3.1单个样品Peak鉴定(peak calling);

3.2全基因组开放染色质区域鉴定;

3.3开放染色质区域在功能元件上的分布特征(注释);

3.4开放染色质区域信号可视化分析;

4转录因子结合基序(motif)富集分析;

5转录因子足迹(footprint)检测(测序量>20X);

6差异开放染色质区域鉴定(至少两组,且每组不少于2个生物学重复);

7差异开放染色质区域关联基因注释及功能富集分析;

7.1差异开放染色质区域关联基因注释;

7.2差异开放染色质区域关联基因GO富集分析;

7.3差异开放染色质区域关联基因KEGG富集分析;