所属公司:武汉影子基因科技有限公司
所 在 地: 湖北省武汉市武汉软件新城3期D5栋4楼
服务电话(移):18672921912
标准信息分析:
1原始测序数据质控;
2质控后的测序读段与参考基因组比对及文库质量评估;
2.1测序读段与参考基因组比对;
2.2评估及去除细胞质基因组污染;
2.3测序读段在基因TSS附近的分布统计;
2.4.文库插入片段长度分布;
2.5.重复样品的相关性分析;
2.6.重复样品IDR分析;
3基因组范围内开放染色质区域鉴定;
3.1单个样品Peak鉴定(peak calling);
3.2全基因组开放染色质区域鉴定;
3.3开放染色质区域在功能元件上的分布特征(注释);
3.4开放染色质区域信号可视化分析;
4转录因子结合基序(motif)富集分析;
5转录因子足迹(footprint)检测(测序量>20X);
6差异开放染色质区域鉴定(至少两组,且每组不少于2个生物学重复);
7差异开放染色质区域关联基因注释及功能富集分析;
7.1差异开放染色质区域关联基因注释;
7.2差异开放染色质区域关联基因GO富集分析;
7.3差异开放染色质区域关联基因KEGG富集分析;
好评度 | 商品满意度 | 服务满意度 | 发货满意度 |
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