1、血浆高丰度蛋白去除
2、DIA蛋白质谱检测:DIA(Data Independent Acquisition)是一项融合了传统蛋白组学“鸟枪法”(shotgun)和选择反应监测/多反应监测(SRM/MRM)技术优势的全新的、全息式数据非依赖性采集定量技术。相比传统的蛋白质组学采用数据依赖采集(DDA)策略,DIA技术避免了DDA策略对于高丰度肽段采集和碎裂的偏向性,对于低丰度肽段的定量具有显著优势。
DIA技术是先利用常规DDA质谱检测技术分析建立图谱库,之后采用DIA方法进行质谱数据采集,从而实现对样品中蛋白质的定性及定量。不同于传统的DDA技术,DIA技术将质谱整个全扫描范围分为若干个可变窗口,根据m/z分布密度计算合理的窗口宽度和数量,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,该技术无需指定目标肽段,扫描点数均匀,可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息,数据利用度大大提高,缺失值更少。
3、差异蛋白筛选和数据分析。
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