染色体是遗传信息的携带者,占据独立的细胞核区域,三维空间结构不具有随机性,具有高度的组织性( Lanctôt et al. 2007)。染色质构像的变化可能涉及生物发育及调控( Sexton et al.2007)。
Hi-C技术源于染色体构象捕获( Chromosome Conformation Capture—3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息学方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA的交互关系( Van Berkum, 2010)。染色质交互的形成对于细胞行使正常的功能起着至关重要的作用( Anastasi et al. 2013)。
Hi-C数据分析能够得到基因组位点间交互信息,将基因组划分为特定大小的bin,从而衡量两个基因组位点( bin)之间的交互强度( Fortin et al. 2015)。 HiC交互数据与ChIP-Seq,转录组数据等进行联合分析,可以从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。
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