14个样品基因组建库测序分析

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14个样品基因组建库测序分析

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货号：CAS20250623

品牌：安诺优达

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DeepBio得分:5567.2

DeepBio得分是基于文献引用次数，影响因子，文献新近度等因素计算的客观产品评级，得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证，质量可信度越高

产品详情

甲方提供14个土壤样品，由乙方完成14个土壤DNA样品的提取建库、测序及质控，每个样品产生不低于8Gb raw/clean data的95%，总测序量不低于560Gb raw/clean data，平均Q20≥80%或。

1 项目信息

1.1 背景介绍

1.2 实验流程

1.3 信息分析流程

1.4 样本信息

2 数据预处理

2.1 原始测序数据

3 基于Reads物种注释

3.1 基于Kraken2的Reads注释

3.2 各分类层级物种统计

3.3 各分类层级物种丰度分布统计

3.4 各分类层级物种丰度聚类热图

4 物种多样性分析

4.1 Alpha多样性分析

4.2 Beta多样性分析

4.2.1 PCA分析

4.2.2 PCoA分析

4.2.3 NMDS分析

5 差异分析

5.1 组间差异判别分析

5.2 组间差异分析

5.3 多组差异分析

6 比较分析

6.1 ANOSIM分析

6.2 adonis分析

6.3 MRPP分析

7 组装分析

7.1 组装结果统计

7.2 碱基组成分析

8 基因预测及丰度

8.1 基于全部组装结果的ORF预测

8.2 获取非冗余基因

8.3 基因丰度计算

8.4 基因丰度样品间相关性

9 基因功能注释

9.1 COG注释及分析

9.1.1 COG注释

9.1.2 β多样性分析

9.1.3 比较分析

9.1.4 差异分析

9.2 EggNOG注释及分析

9.2.1 EggNOG注释

9.2.2 β多样性分析

9.2.3 比较分析

9.2.4 差异分析

9.3 Swiss-Prot注释

9.3.1 β多样性分析

9.3.2 比较分析

9.3.3 差异分析

9.4 PHI注释

9.4.1 β多样性分析

9.4.2 比较分析

9.4.3 差异分析

9.5 VFDB注释及分析

9.5.1 VFDB注释

9.5.2 β多样性分析

9.5.3 比较分析

9.5.4 差异分析

9.6 ARDB注释

9.6.1 β多样性分析

9.6.2 比较分析

9.6.3 差异分析

9.7 CARD注释及分析

9.7.1 CARD注释

9.7.2 β多样性分析

9.7.3 比较分析

9.7.4 差异分析

9.8 BacMet注释及分析

9.8.1 BacMet注释

9.8.2 β多样性分析

9.8.3 比较分析

9.8.4 差异分析

9.9 CAZy功能注释

9.9.1 β多样性分析

9.9.2 比较分析

9.9.3 差异分析

9.10 GO注释

9.10.1 β多样性分析

9.10.2 比较分析

9.10.3 差异分析

9.11 KEGG注释

9.11.1 β多样性分析

9.11.2 比较分析

9.11.3 差异分析

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