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16S rDNA是一种对特定环境(或者特定生境)样品中所有的细菌进行高通量测序,以研究环境样品中微生物群体的组成,解读微生物群体的多样性、丰富度及群体结构,探究微生物与环境或宿主之间的关系的技术。传统的微生物研究依赖于实验室培养,16S扩增子等高通量测序的兴起填补了对无法在传统实验室中培养的微生物的研究空白,扩展了对微生物资源的利用空间,为研究微生物相互作用提供了有效工具。
16S rDNA位于原核细胞核糖体小亚基上,指的是基因组中编码核糖体16S rDNA分子对应的DNA序列,也就是16S rDNA的编码基因。该基因全长约1542bp,由9个可变区和10个保守区组成(可变区为V1到V9),其中保守区反映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关,被认为是最适于细菌系统发育和分类鉴定的指标。
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