10X单细胞转录组测序
10x Genomics平台利用微流控技术分选单个细胞,然后将带有细胞标签信息的核酸碱基序列(barcode)和引物的凝胶珠(Gel Beads)以及单个细胞包裹在油滴中,形成油包水结构(Gel Bead-in-Emulsion,GEMs);在油滴中凝胶珠溶解释放反转录反应试剂,细胞裂解释放mRNA,通过SMART法获得用于测序的带barcode的cDNA;液体油层破坏后,cDNA进行后续文库构建,使用Illumina测序平台(NovaSeq 6000或NovaSeq X)检测,即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据,细胞捕获率最高可达65%。可实现大量单细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大规模单细胞表达图谱,来探究组织的异质性问题、细胞发育问题和组织内新细胞群体的发现。
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