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DeepBio得分:5567.2
DeepBio得分
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基因组在线性序列中存储了遗传信息，但DNA和染色体存在于细胞核的三维空间中，基因的正确表达、调控以及基因调控元件之间的相互作用都是在染色体折叠成的复杂三维结构中完成的，染色体的三维空间结构对基因的表达和调控具有重要影响。高通量染色体构象捕获（High-throughput chromosome conformation capture, Hi-C）则是一种可用于研究三维结构中空间邻近的染色质发生互作的创新技术。
通过对细胞核内染色体构象进行固定、酶切、连接、捕获等步骤，对捕获的含有染色质互作信息的片段进行高通量测序，再通过生物信息学分析，能够在全基因组范围内获得不同区域间染色质DNA在空间位置上的相互作用，发现三维空间中的远程调控元件，揭示空间结构调控基因功能发挥的机制。
Hi-C 3.0互作分析应用方向广泛但不局限于以下研究：
(1) 构建全基因组互作图谱，寻找线性距离远而空间位置邻近的调控元件，研究基因组空间结构
（compartment、TAD、loop结构）可揭示基因组空间结构调控基因表达的机制；
(2) 研究病理细胞或组织的基因组三维结构，与WGS、RNA- seq、ATAC-seq、ChIP- seq/CUT&Tag等多组学联合分析，可深度解析疾病和癌症的发生机理；
(3) 比较细胞生长发育或分化阶段的染色质空间结构变化，可揭示环境变化或生长发育过程中基因组三维结构的适应性变化。
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