真菌Hi-C建库测序

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真菌Hi-C建库测序

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货号：whfs-xs-241467-2

品牌：Frasergen

计量单位：碱基

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DeepBio得分:5567.2

DeepBio得分是基于文献引用次数，影响因子，文献新近度等因素计算的客观产品评级，得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证，质量可信度越高

产品详情

Hi-C（High-throughput/resolution chromosome conformation capture）主要步骤是先制备适合Hi-C的3C模板，限制酶切割后末端连接生物素标记的核苷酸。钝端连接之后DNA纯化剪切。生物素pull-down保证只有连接的部分用于分析。读长reads被定位到基因组上，当这一对读长发现在不同片段上的时候，对互作片段进行相应评分。这样，一个包含基因组所有片段的连接频率矩阵被构建。Lieberman-Aiden等发现，哺乳动物HiC试验的分辨率为~1Mb(~10 RMPD，million paired-end reads)。通过4C确定试验在Hi-C可以得到验证。Hi-C试验让科学家们发现，核内存在特定的染色质区隔（Chromatin Compartment），染色质和异染色质在不同的区域（Open区和Close区）。Cell等发现，人类不同类型细胞系，细胞核染色质组织大致相同。总之，Hi-C方法是全基因组范围内，不限制特定互作蛋白为局限，利用高通量测序（二代或三代）的基于“全对全”模式的染色质互作构象分析方法。在人类，小鼠上都有相关发现发表。

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