(1)检测方法:搜库和数据处理采用maxquant;检测步骤包括:蛋白提取→胰酶酶解→LC-MS/MS 质谱分析→数据库搜索→数据质量控制→生信分析。
(2)分析方法:搜库和数据处理采用 MaxQuant 软件,生信分析包括基础分析+高级分析+个性化分析,可以根据客户的分析需求,提供个性化分析服务。分析内容应包括质量控制(肽段长度分布、肽段质量误差分布、定量分布、定量火山图、定量重复性分析和修饰位点分布)、注释(蛋白功能描述、亚细胞结构定位、GO 功能分类、KEGG 通路、蛋白结构域和 COG 分类)、功能分类(GO 二级功能分类、亚细胞结构定位和 COG 分类)、富集分析和聚类分析(GO 功能分类、KEGG 通路和蛋白结构域)、修饰位点分析。
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