宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以样本中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养[1,2],直接提取样本 DNA 进行测序,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域[3]。技术原理是将样品中的所有基因组 DNA 随机打断成300bp 左右的小片段,基于llumina 高通量测序,利用双末端测序(Paired-End)的方法,再通过组装的方式将小片段拼接成较长的序列,分别和物种数据库和功能数据库比对,进行微生物群落结构多样性,基因功能,代谢通路等分析,从而进一步发掘和研究具有应用价值的功能基因及通路
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