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DeepBio得分:5567.2
DeepBio得分
是基于文献引用次数,影响因子,文献新近度等因素计算的客观产品评级,得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证,质量可信度越高
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产品属性
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1. 样品的质检,可以从以下方式中选择此合同的生物样本来源:
(1) 甲方提供提取的蛋白样品,要求其蛋白浓度不低于2 μg/μl,每个样品总量不少于0.4 mg。
2. 分析服务流程:
(1) 乙方对甲方提供的 人类 物种 9 份蛋白样品进行胰酶酶切消化。
(2) 乙方使用iTRAQ® Mass Tagging Kits对消化的蛋白样品进行化学标记,最多可以使用8种不同的标签标记样品。
(3) 乙方根据甲方的要求对___3____个标记好的蛋白样品进行混合,详细的样品混合方案见甲方填写的《样品检测需求单》。
(4) 乙方使用反相色谱柱对混合的肽段样品进行初分离,并将每个混合样品分成__20_个组分。
(5) 乙方对每个组分使用液相色谱-质谱联用进行定性和相对定量检测。
(6) 乙方利用甲方提供的蛋白数据库或根据甲方提供的信息下载相应蛋白数据库对质谱检测数据进行分析,给出每个样品检测到的蛋白种类,同时计算不同样品间蛋白的相对表达量。
(7) 其他约定:
3. 甲乙双方已完全了解上述服务内容,并补充约定如下:
(1) 在确保实验准确性和可靠性的前提下,有可能出现进行实验的两个样品没有差异表达的基因或者很少。其原因可能是进行实验的这两个样品的基因表达确实不存在显著差异。
(2) 甲方使用乙方提供的实验结果、数据发表文章、申请成果时,甲方要注明实验结果、数据来源于乙方,但乙方在本合同研究结果整理的科学论文中不予署名。
4. 乙方提供的基本数据分析包括
(1) 蛋白质定性检测
(2) 差异蛋白分析(样本数不少于2;默认筛选Fold Change>1.5或<0.667的蛋白作为差异蛋白)
5. 乙方提供的高级数据分析包括:
(1) 蛋白注释分析
(1.1) Gene Ontology功能注释
(1.2) Pathway注释 (相关数据库包括:KEGG Pathway、PID、BioCarta、Reactome、BioCyc、PANTHER)
(2) 差异蛋白富集分析
(2.1) Gene Ontology功能富集分析
(2.2) Gene Ontology富集层次图
(2.3) Pathway富集分析 (相关数据库包括:KEGG Pathway、PID、BioCarta、Reactome、BioCyc、PANTHER)
(2.4) KEGG Pathway图
(3) 差异蛋白相关疾病注释(只限于人,包括5个人类疾病数据库:OMIM、KEGG DISEASE、FunDO、GAD、NHGRI GWAS Catalog)
(4) 差异蛋白聚类分析(样本数不少于3个)
(5) 样品相关性分析
(6) 差异蛋白互作网络分析(只限于蛋白互作数据库中已收录的物种)
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