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DeepBio得分:5567.2
DeepBio得分
是基于文献引用次数，影响因子，文献新近度等因素计算的客观产品评级，得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证，质量可信度越高
随着高通量测序技术和生物信息学的快速发展，细菌全基因组de novo测序已然成为一种探究细菌生物学问题的高性价比方法。通过全基因组测序，可以获知待测菌株的基因及相关调控信息，为研究该菌株特有的生物学特征（致病机制，共生机制，独有的代谢机制）提供分子生物学基础；通过比较基因组分析，为研究菌株种内及种间的功能差异、进化关系提供理论指导。
目前，细菌基因组测序已经广泛应用于细菌流行病学、疫苗开发、微生物进化等多个领域。此外，细菌全基因组de novo测序为该物种后续基因组数据的挖掘以及重要基因的功能分析构建一个全面的研究平台。
构建nanopore（~10K）文库和Illumina PE（400bp）文库，利用nanopore平台和Illumina Hiseq平台测序，de novo组装获得基因组完成图并进行生物信息分析。
美吉优势
拥有交互式细菌基因组分析云平台，分析内容全面，数据交付快速，性价比更高。
拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，保证高质量的数据；
拥有多种测序平台和强大的计算机资源，提供最佳的测序解决方案和快速的数据分析平台；
拥有专业的分析团队，全面的分析内容，提供全面和高质量的基因组解析结果。
实验流程
生信分析
技术参数
1.承诺指标
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产品 |
承诺技术指标 |
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细菌扫描图 |
基因组覆盖度大于95%，基因区覆盖度大于98%；单碱基平均错误率低于十万分之一 |
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细菌完成图 |
0 GAP，1 contig；单碱基平均错误率低于十万分之一 |
2.项目周期（从质检合格到标准分析结束）
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产品 |
承诺项目周期 |
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细菌扫描图 |
15-20个自然日 |
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细菌完成图 |
45-55个自然日 |
3.送样要求
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样品类型 |
送样要求 |
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菌体 |
菌体不宜培养时间过长，以对数生长中期细胞最佳； 样品量：扫描图≥3O D·mL的菌液对应的菌体沉淀，完成图≥50O D·mL的菌液对应的菌体沉淀；D·mL=OD600的值*菌液体积 将装有菌体沉淀的离心管在干冰/冰袋条件下寄送，或是暂时存放于-80℃后再干冰/冰袋寄送。另送1-2份样品备份； |
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DNA |
样品量：扫描图DNA总量≥1μg，浓度≥20ng/µL，完成图DNA总量≥1μg，浓度≥20ng/µL； DNA质量：OD260/280=1.8-2.0，OD260/230=1.8-2.2；DNA的主峰带明显且在2kb以上，无明显RNA污染； 为了避免DNA样品的降解，寄送过程中务必保证足够的干冰/冰袋，避免样品反复冻融，送样时注明溶剂组分； 注：老师在拿到DNA胶图后，如不确定样品是否合格，可在送样之前先将胶图发送到mdna@majorbio.com，由技术人员评估确认后再进行样品寄送；病原微生物只接受DNA样本。 |
| 好评度 | 商品满意度 | 服务满意度 | 发货满意度 |
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