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宏基因组学（又称元基因组学，环境基因组学，生态基因组学等），是研究直接从环境样本中提取的基因组遗传物质的学科。传统的微生物研究依赖于实验室培养，宏基因组基于高通量测序技术，针对环境复杂样本的微生物多样性及微生物功能基因进行研究。
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