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DeepBio得分
是基于文献引用次数,影响因子,文献新近度等因素计算的客观产品评级,得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证,质量可信度越高
iTRAQ由AB SCIEX公司于2004年开发的定量组学研究技术,该技术可以用于比对多个样品中的蛋白。比如,在不同的病理情况下或疾病的不同发展阶段,研究组织样品中蛋白表达水平的差异。iTRAQ可以使用8中不同的同位素试剂同时标记8中不同蛋白样品。利用质谱结合Itraq技术可以轻易对复杂蛋白样品进行快速的相对定量,从而用于生物标志物的发现。iTRAQ适合用于正常样品、疾病样品和药物处理样品之间的比较、时程研究、生物重复或相对定量。iTRAQ分子主要包括三部分:报告基团、平衡基团、反应基团。
iTRAQ实验流程
蛋白经过还原、烷基化、胰酶酶切后形成肽段,反应基团与肽段的N-端氨基和赖氨酸侧链氨基反应,从而使肽段连上不同化学标签。iTRAQ标记效率可达99%以上,不同样品的多肽可以与不同标签的iTRAQ试剂反应,这样就可以通过不同标签区分不同样品来源的肽段,因此可以将全部肽段样品进行混合以消除不同时间质谱分析带来的仪器误差影响。在LC-MS/MS的一级质谱中各个不同来源的多肽具有相同的质荷比和保留时间,在二级质谱分析中报告基团从肽链上碎裂,通过比较报告基团的信号强度即可知道不同样品中肽段和蛋白质的相对丰度。

iTRAQ的优势
1. 一次iTRAQ实验可以同时标记4-8个样品,操作简单快速。适合用于高通量检测多种样品且实验设计更加灵活。
2. iTRAQ在肽段水平的体外标记方法,适合所有类型的生物样本。
3. iTRAQ具有优秀的可重复性及高灵敏度,可同时进行定性和定量分析。
TMT实验流程
10个样品的蛋白经过还原、烷基化、胰酶酶切后形成肽段,这些多肽标记TMT试剂后混合成一个样品。混合后样品使用反向色谱进行分级,分级样品再 经过合并成为12-16个分级样品,这样可以提高样品的定性与定量深度。在LC-MS/MS的一级质谱中各个不同来源的多肽具有相同的质荷比和保留时间,在二级质谱分析中报告基团从肽链上碎裂,通过比较报告基团的信号强度即可知道不同样品中肽段和蛋白质的相对丰度。

TMT的优势
1.高灵敏度:可以鉴定到底丰度蛋白
2.高分离能力:可以区分酸性/碱性蛋白,小于10KD或大于200KD蛋白,不可溶蛋白等
3.应用范围广泛:可鉴定包括膜蛋白、核蛋白和胞外蛋白在内的任何类型蛋白,
4.分析通量高:可同时分析10个样品,特别适合多个处理方法/时间的差异蛋白分析
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