蛋白非标记定量分析是指不需要稳定同位素标记样本,每个样本分别上机检测。由于不需要对样本进行标记,蛋白非标记定量分析技术成本较低,并且对一次检测的样本量无限制,可同时比较多个样本的蛋白质表达差异。根据质谱数据采集模式的不同,蛋白非标记定量又分为利用数据依赖采集模式(DDA)的label free方法(LFQ),和利用数据非依赖采集模式(DIA)的DIA方法。蛋白定量DIA技术将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,因此可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息,数据利用度大大提高,缺失值更少。因此重复性大幅提升,定量准确性更高。蛋白定量DIA技术被Nature Methods杂志评为2015年最值得关注的技术,近年来受到了越来越多的关注。
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