技术概述
ChIP-Seq是研究体内蛋白与DNA互作的重要技术。该技术先用甲醛等试剂交联固定细胞内的“蛋白-DNA”复合物,裂解并超声处理细胞,用目的蛋白特异的抗体(或标签抗体)做免疫沉淀,获取“目的蛋白-DNA”的复合物,去交联分离复合物中的DNA做高通量测序,即可找到可能与目的蛋白互作的DNA序列。
技术应用
转录因子结合位点及组蛋白修饰研究等。
技术流程
服务信息
参考文献
1.Diverse transcription factor binding features revealed by genome-wide ChIP-seq in C. elegans. Genome Res 21(2):245-254(2011).
2.Role of ChIP-seq in the discovery of transcription factor binding sites, differential gene regulation mechanism, epigenetic marks and beyond. Cell Cycle 13(18):2847-2852(2014).
3.ChIP-seq reveals the global regulator AlgR mediating cyclic di-GMP synthesis in Pseudomonas aeruginosa. Nucleic Acids Res 43(17):8268-8282(2015).
4.Liver ChIP-seq analysis in FGF19-treated mice reveals SHP as a global transcriptional partner of SREBP-2. Genome Biol 16:26(2015)8.
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