常用商品分类
DeepBio得分:5567.2
DeepBio得分
是基于文献引用次数，影响因子，文献新近度等因素计算的客观产品评级，得分越高表明该产品经过越可靠的实验验证，质量可信度越高
对小鼠的6个细胞系/组织样品进行CUT&Tag实验，采用二代测序平台（PE150模式），获得靶蛋白结合位点信息。每个样本测序量~6Gb（Raw data，可上下浮动~2Gb）。（样本描述：6个样本分为2组，各3个生物学重复）
|
|
具体分析内容 |
备注 |
|
数据质控 |
1.测序数据质量控制； 2.数据过滤比对； 3.文库插入片段长度分布； 4.TSS富集分析； 5.Gene body富集分析； 6.Peak检测和peak富集分析； 7.Peak可重复性分析； 8.数据可视化。 |
甲方需向乙方提供此物种的参考基因组及注释信息的准确链接 |
采用BGI PE150测序平台，完成（6）个（小鼠）（物种拉丁名）的转录组信息采集，每个样品产生_6Gb数据量，并完成相应的信息分析。
（备注：单个样本交付数据量若低于合同承诺数据量的95%，由菲沙安排进行加测；若交付数据量达到合同承诺数据量的95%，但不足100%，在不影响分析效果的前提下，不再加测，正常开展后续分析）
|
（有参考基因组） |
具体分析内容 |
备注 |
|
基础分析 |
1.原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理； 2.测序数据产量统计及质量评估； 3.参考序列比对分析； 4.基因表达水平分析（PCA分析，限两组或以上样本）； 5.转录本整体质量评估； 6.样本间相关性分析（两个或以上样本）； 7. 基因差异表达分析（两个或以上样本）； 8.差异表达基因表达模式聚类分析（两个或以上样本）； 9.差异表达基因功能注释及GO、KEGG富集分析（两个或以样本）； 10. 新基因、转录本预测； 11.新基因功能注释：GO、KEGG、NR、swissprot与COG功能注释分析； 12.SNP/Indel检测； |
需甲方向乙方提供所做样本的参考基因组序列及注释文件 |
|
高级分析 |
13.差异表达基因蛋白互作网络分析（两个或以上样本）； 14.转录因子分析（仅限动、植物）； 15. lncRNA鉴定； 16.差异可变剪切。 |
|
|
备注 |
|
|
| 好评度 | 商品满意度 | 服务满意度 | 发货满意度 |
"小鼠CUT&TAG+RNA-seq"商品可能已被商家删除，您可查看其他相似商品！
相似产品推荐
购物车（0）
分类纠错
举报
纠错
收 藏
比价
线下结算
公务卡
网银支付
微信
支付宝